تم الإدعاء على قائد الجيش السابق جان قهوجي بتهمة القتل القصدي “مواد ٥٨٧ و ٥٨٨” في قضية مرفأ بيروت والتي تصل عقوبتها للإعدام كما و وجهت التهم نفسها من قبل المحقق العدلي الى كل من مدير المخابرات السابق كميل ضاهر، والعميد جودت عويدات و العميد غسان غرز الدين